Auf den ersten Blick würde ich sagen, dass es schwierig wird. Wenn du die Schlitze mit feinem Filterschwamm verschließt, kommt da auch deutlich weniger Wasser durch und das ganze Konzept von dem Filter geht nicht mehr richtig auf. Ob Garnelen wirklich bis zur Pumpe kommen und da Schaden nehmen können vermag ich nun so in der Theorie nicht zu sagen, du wist aber definitiv eine Garnelenpopulation innerhalb dieses Filtergehäuses haben nach einiger Zeit.
Entweder du testest es einfach und schaust was passiert, oder du trennst sofern machbar den kompletten Filter heraus und ersetzt ihn.
Oder du tauschst das Becken gegen eins ohne eingebauten Innenfilter...